確認しているのは、mxmlのスクリプト内で生成するサブウィンドウをFlexChromeでtranparent = trueにしたとき。transparent = falseにすればsqliteにも日本語登録できそうな感じです。
AIR1.1で改善されている可能性も高いのですが一応メモしておきます。
【追記5/1】
と書いてしまったものの、いろいろ環境変えて試してみると再現性高く無いかも。
とにかく、日本語入力出来ないのは、transparent = true 以外の要因もあるみたいです。
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